凭借世界上最大的病毒-细菌交互组资源库，Phase Genomics 公司将设计出一个预测引擎，用于开发抗药性生物威胁的新疗法
东部夏令时间 2022 年 6 月 09 日下午 03:39
美国西雅图–(BUSINESS WIRE)–(美国商业资讯)–基于近端连接的基因组解决方案的领先开发商Phase Genomics, Inc.今天宣布从比尔及梅林达-盖茨基金会（Bill and Melinda Gates Foundation）和美国国家过敏症和传染病研究所（NIAID）获得550万美元的非稀释性联合资助。有了这笔新资金，Phase Genomics 公司将利用其世界上最大的噬菌体-细菌交互组资源库，为治疗性噬菌体发现开发独特的人工智能驱动预测引擎提供动力。
“我们确实处于如何改善人类状况的新认识的前沿”。
噬菌体是一种捕食细菌的病毒，也是人类对抗抗生素耐药性感染的有效工具。尽管噬菌体是地球上最丰富的生命形式，但目前很少有噬菌体与其目标之间相互作用的记录。Phase Genomics 公司的专利技术可以直接捕捉微生物群落中病毒与宿主之间的相互作用，无需培养，甚至可以从单一样本中快速发现数百种新噬菌体及其靶标。
新的融资包括盖茨基金会提供的 350 万美元赠款和美国国立卫生研究院（NIAID）提供的 200 万美元 SBIR 奖金，这将使 Phase Genomics 公司能够利用其近距离引导的元基因组学平台 ProxiMetaTM 开发世界上最大的噬菌体-细菌相互作用图谱，并利用机器学习工具识别可用于艰难梭菌感染、溃疡性结肠炎和克罗恩病等治疗的噬菌体。这项技术还将改善对废水中抗药性病原体的监测。
“Phase Genomics 公司的创始人兼首席执行官 Ivan Liachko 博士说：”我们确实处于如何改善人类状况的新认识的前沿。”利用病毒和细菌如何相互作用的知识的潜力是巨大的。与我们的战略合作伙伴共同努力，将有助于开发全球生物防御盾牌，预防大流行病。我们计划将新的噬菌体图谱作为一种资源，帮助对抗病原体爆发和其他生物威胁，包括过度使用抗生素导致的耐药性。
抗菌药耐药性（AMR）感染是导致棘手疾病的主要原因。全球健康专家预计，到 2050 年，它将使全球每年的健康支出增加 1.2 万亿美元，并将超过癌症成为死亡的主要原因。
对全球微生物种群的广泛了解有助于在 AMR 爆发之前预测其潜在来源。它还可以预测流行病的严重程度，并帮助开发保护措施，如基于噬菌体的疗法。Phase Genomics 公司将利用这笔资金，通过大规模的国际样本收集，扩大其 AMR 地图集的覆盖范围，以监测不同细菌群落中带有抗药性特征的移动遗传因子的扩散情况。
“噬菌体疗法是克服迫在眉睫的公共AMR健康危机的一条大有可为的途径，但我们对病毒-微生物相互作用和细菌宿主范围的了解有限，这严重阻碍了这项技术的发展，”著名遗传学家、教授克里斯-梅森（Chris Mason）博士说。”通过将机器学习工具与庞大的噬菌体相互作用组数据存储库相结合，我们最终将揭示一个巨大的科学盲点，这将有助于推动全球公共卫生事业的发展，并帮助减轻未来大流行病带来的灾难。”
最近发表在《自然-生物技术》（Nature Biotechnology）上的一项研究证明了 Phase Genomics 独特技术的威力。研究人员利用Phase Genomics公司的ProxiMetaTM元基因组解卷积平台，描述了分系的微生物群落，将移动遗传元素与宿主基因组进行了比对，并在单个微生物组样本中发现了数百种新型噬菌体-宿主关联。
关于 Phase Genomics
Phase Genomics 采用专有的近接技术实现染色体组规模的基因组组装、元基因组解旋以及结构基因组变异和基因组结构分析。除了全面的实验室和计算服务及产品组合（包括用于植物、动物、微生物和人类样本的 Hi-C 试剂盒）外，他们还提供业界领先的基因组和元基因组组装与分析软件。
公司总部位于华盛顿州西雅图市，由基因组科学家、软件工程师和企业家团队于 2015 年创立。公司的使命是为科学家提供基因组工具，加速突破性发现。